El Centro de Supercomputación y Bioinnovación de la Universidad de Málaga– SCBI- ha aumentado un 40 por ciento su capacidad de almacenamiento y cálculo de datos con la incorporación de 168 nuevas máquinas y un incremento de 2’5 millones de gigabytes en disco (2,5 Petabytes).
‘Picasso’, el supercomputador de la UMA, nodo de la Red Española de Supercomputación (RES) desde 2006, se convierte en la infraestructura informática número tres, junto a la de Madrid y Barcelona, que con la red ‘Infinity Band’ dispone de un ancho de banda agregado -la información en datos que se puede transmitir entre un punto y otro- de 5.000 gigabits/segundo.
Más de 200 investigadores se benefician
248 investigadores repartidos por todo el mapa español y europeo, de los que 99 son de Andalucía y, en concreto, 76 grupos de la UMA, se benefician actualmente de este servicio abierto a toda la comunidad científica, pero bajo la supervisión de un comité experto encargado de la designación de proyectos que, como mínimo, deben requerir 1 millón de horas de cálculo.
“Nuestro servicio recibe demandas de todas las áreas de conocimiento, siendo la bioinformática, la química física, los materiales y la mecánica de fluidos las más frecuentes”, afirma el catedrático de Arquitectura de Computadores y director del SCBI, Emilio López Zapata, quien también informa que para los miembros de la UMA y la Red Española de Supercomputación es gratuito. Asimismo, el Centro también está abierto a cualquier investigador de Europa y a empresas externas.
Fases de ampliación
Este año hay previstas dos ampliaciones importantes. La primera, ya finalizada, es la ampliación de la capacidad de procesamiento mediante 2688 cores. En la segunda, que se realizará antes de finales de año, se ampliará la capacidad de almacenamiento en disco hasta los 2,5 Petabytes.
López Zapata asegura que ‘Picasso’ cuenta con 7 máquinas con 2.000 gigabytes de memoria RAM cada una, siendo únicas en la RES, lo que supone la recepción exclusiva de proyectos nacionales que requieran este servicio.
Así, proyectos como la reconstrucción tridimensional de virus, que según el profesor de la UMA exige 8.000 gigabytes de memoria RAM, son procesados desde la UMA en mucho menor tiempo que en el resto de nodos de la RES.
Interpretación de resultados
El SCBI es la infraestructura tecnológica de la Plataforma Andaluza de Genómica, Proteómica y Bioinformática. Así, ha desarrollado un conjunto de flujos de procesamiento y análisis de datos que simplifican a los investigadores en ómicas el uso de la supercomputación. Además, el SCBI les apoya con un servicio de interpretación de los datos.
Para la ejecución de esta innovación tecnológica, la Universidad de Málaga ha recibido 2’5 millones procedentes del Fondo Europeo de Desarrollo Regional (FEDER). 1,5 millones de la RES y 1 millón por parte de la UMA, a través del Vicerrectorado de Investigación.
El equipo
El supercomputador ‘Picasso’ cuenta para su gestión con los técnicos informáticos y doctores Rafael Larrosa y Darío Guerrero. El análisis e interpretación de los datos ómicos los realiza la doctora Rocío Bautista, con el apoyo del profesor Gonzálo Claros. Para reforzar este servicio está prevista la incorporación inminente de un nuevo técnico en bioinformática.
El SCBI se ubica en el edificio de Bioinnovación del Parque Tecnológico de Andalucía. Aunque fue inaugurado en el año 2006, la apuesta de la Universidad de Málaga por la supercomputación se inició en 1995. Desde entonces ha mantenido el liderazgo en Andalucía.
