Chirinos nace en Lima en 1960. Estudia en la Universidad Católica de esa ciudad donde se licencia en literatura y lingüística. Vive en España dos años (1986 y 1987) gracias a una beca de investigación otorgada por el Instituto de Cooperación Iberoamericana.
Fue profesor en la Universidad Católica de Lima entre 1988 y 1993, año en que viaja a los Estados Unidos para hacer estudios de doctorado. En 1997 se doctoró con una tesis sobre El silencio en la poesía hispanoamericana contemporánea. Desde entonces ha ejercido como profesor en Universidades de Nueva York y Pennsylvania. Actualmente reside en Missoula, Estados Unidos, donde es profesor de Literatura Hispanoamericana y Española en la Universidad de Montana.
Eduardo Chirinos es autor de los siguientes libros de poesía: Cuadernos de Horacio Morell (Lima, 1981, reeditado en 2006); Crónicas de un ocioso (Lima, 1983); Archivo de huellas digitales (Lima, 1985); Rituales del conocimiento y del sueño (Madrid, 1987); El libro de los encuentros (Lima, 1988); Canciones del herrero del arca (1989), Recuerda, Cuerpo… (Madrid, 1991); El Equilibrista de Bayard Street (Lima, 1998), Abecedario del Agua (Valencia, 2000); Breve historia de la música (Premio Casa de América de Poesía, Madrid, 2001); Escrito en Missoula (Valencia, 2003); No tengo ruiseñores en el dedo (Valencia, 2006) e Himno de incendios lejanos (2009).
En 1999 la editorial sevillana Renacimiento publicó una selección antológica de sus poemas bajo el título Naufragio de los días (1978-1998).
En el 2003 la Editorial Filodecaballos de Guadalajara (México) publicó su antología personal Derrota del otoño.
Como crítico literario, Eduardo Chirinos ha publicado El techo de la ballena (1991), La morada del silencio (1998) y Nueve miradas sin dueño (2004), ensayos sobre la modernidad y sus representaciones en la poesía hispanoamericana y española. También ha editado dos volúmenes de poesía peruana: Loco amor (1991) e Infame turba (1992, 1997), la antología Elogio del refrenamiento de José Watanabe (Sevilla, 2003), y tres libros misceláneos donde conviven la prosa crítica con la crónica y el verso: Epístola a los transeúntes (Lima, 2001), El Fingidor (Lima, 2003) y Los largos oficios inservibles (2004).
La editorial Pre-Textos ha publicado Sólo una canción, antología traducida de la obra poética de Mark Strand (2004) y El iris salvaje, de la poeta norteamericana Louise Glück (2006). En colaboración con Isabel Aguiar Barcelos ha escrito una novela para niños titulada Guilherme. El koala que llegó por internet (Alfaguara, 2005).
Con Mientras el lobo está Chirinos ha obtenido el XII Premio de Poesía Generación del 27, publicado en Visor. Madrid. 2010